ปัจจุบันระบบนิเวศทางทะเลของประเทศไทยกำลังประสบปัญหาอย่างหนักซึ่งเกิดจากมลพิษทางทะเลที่ส่วนใหญ่มาจากการกระทำของมนุษย์ที่ขาดไร้ซึ่งความรับผิดชอบต่อสิ่งแวดล้อมทางธรรมชาติ เช่น การประกอบอุตสาหกรรม การประกอบเกษตรกรรม การประกอบพาณิชยกรรม และการท่องเที่ยว ซึ่งส่วนใหญ่ล้วนเป็นแต่กิจกรรมที่มุ่งเน้นเพื่อพัฒนาขับเคลื่อนทางเศรษฐกิจและสังคม โดยใช้ทรัพยากรธรรมชาติเป็นฐานการผลิต ซึ่งมิได้คำนึงถึงผลกระทบและความเสียหายที่เกิดกับระบบนิเวศทางทะเลและชายฝั่งทั้งหมด ปัญหาดังกล่าวมีสาเหตุมาจากการขาดความเข้าใจในการแก้ไขปัญหาสิ่งแวดล้อมทางทะเลอย่างเป็นระบบและยั่งยืน